两者的区别主要在于培养方向和学习年限上，专硕着重于面向市场的应用型人才的培养，学习年限一般为两年或者两年半；学硕着重于学术研究型人才的培养，学习年限通常为3年。当然了在学费也会有一些细微的差别。一个重在理论，一个重在实践，只是二者的培养目标稍微不同，共同的是都是为了更好的专业发展。
第一，培养目标不同
学术硕士按学科设立，其以学术研究为导向，偏重理论和研究，培养学术研究人才。
专业硕士与学术硕士处于同一层次，培养规格各有侧重，在培养目标上有明显差异。
专业硕士教育的突出特点是学术型与职业性紧密结合，获得专业学位的人，主要不是从事学术研究，而是从事具有明显职业背景的工作，如工程师、医师、教师、律师、会计师等。这是一种以专业实践为导向，重视实践和应用，培养在专业和专门技术上受到正规的、高水平训练的高层次人才的培养方式。
第二，培养方式不同
学术硕士的课程设置侧重于加强基础理论的学习，重点培养学生从事科学研究创新工作的能力和素质。
专业硕士课程设置以实际应用为导向，以职业需求为目标，以综合素养和应用知识与能力的提高为核心。教学内容强调理论性与应用性课程的有机结合，突出案例分析和实践研究;教学过程重视运用团队学习、案例分析、现场研究、模拟训练等方法;注重培养学生研究实践问题的意识和能力。在具体的学习过程中，要求有为期至少半年的实践环节，实践学分比重较学术学位更大。
第三：报考条件不同
学术硕士，一般专、本科及以上学历可报考，除专科要求毕业至少2年以上才能报考外，本科及以上学历对毕业年限没有要求，也就是应届生和往届生均可报考。
专业硕士，部分专业报考要求和学术硕士相同，但其中的工商管理、公共管理、工程管理、旅游管理、工程硕士中的项目管理、教育硕士中的教育管理、体育硕士中的竞赛组织专业，则要求专科至少毕业5年，或本科毕业至少3年，或获得硕士/博士学位至少2年，才能报考。
第四：招生专业不同
学术硕士，招生专业包括哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、军事学、管理学、艺术学13大学科，及其下设的一级学科、二级学科，涵盖所有专业方向。
专业硕士，招生专业比较有针对性，根据研招网“专业知识库”显示，“专业学位硕士研究生”招生专业包括金融、应用统计、税务、国际商务、保险、资产评估、审计、法律、社会工作、警务、教育、体育、汉语国际教育、应用心理、翻译、新闻与传播、出版、文物与博物馆、建筑学、城市规划、电子信息、机械、材料与化工、资源与环境、能源动力、土木水利、生物与医药、交通运输、农业、兽医、风景园林、林业、临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学、中药学、中医、军事、工商管理、公共管理、会计、旅游管理、图书情报、工程管理、艺术等，共计47个专业。
注：具体到某一招生单位的某一具体专业是否招生，请参照招生单位当年的招生专业目录。
第五：调剂要求不同
一般情况下，考研调剂，学术硕士可以调剂到专业硕士。但专业硕士不能调剂到学术硕士。
第六：学习方式不同
学术硕士： 全日制或非全日制学习，学制一般为3年。
专业硕士：全日制或非全日制学习，学制2-3年，非全日制学制适当2-3年。
第七：学费不同
学术硕士：基本为每生每年8000元
第八：颁发的学位不同
学术硕士，颁发普通的硕士学位，而专业硕士颁发的是专业学位。
第九：学位论文不同
学术硕士的学位论文，强调科学理论研究与原创学术创新，一般为学术性论文。
专业硕士的论文强化应用导向，形式可多种多样。鼓励采用调研报告、规划设计、产品开发、案例分析、项目管理、文学艺术作品等多种形式。
第十：读博方式不同
学术硕士可以通过自己的导师直接读博，不用参加全国统考，也就是我们所说的直博或者硕博连读。专业硕士一般不能硕博连读或直博，硕士毕业后若进行考博，请咨询招生单位了解相关政策。
专业硕士：普遍高于学硕，一般为每生每年12000元左右，部分热门专业学费较高，具体视专业和学校而定。
虽然学术硕士和专业硕士大部分专业，在就业上并无明显差异，但是部分专业，专业硕士要好于学术硕士，比如：专业型的MBA就业认可度明显比学术型的管理学要高；专业型的临床医学硕士认可度比学术型的医学硕士要高一些，甚至很多医院只认临床医学；专业型的会计硕士认可度比学术型会计学硕士要高。
其实都说学硕比专硕好，但是我觉得这个要看自己的一个意愿的，学硕就是学术研究，专硕的话很注重实践。学硕的和专硕的区别在于年限考核方式还有就是一个研究方式。
