1、食材不同：巴斯克蛋糕用的食材有低筋面粉、无盐黄油、细砂糖，外部用油酥面团，内部用糕点奶油。芝士蛋糕用的食材有奶油奶酪、鸡蛋、糖、奶油、牛奶、酸奶酪等。2、外形不同：巴斯克蛋糕的外形呈现出灰褐色，外部轮廓不平整；芝士蛋糕外部非常华丽，有很多种色彩，很光滑。3、做法不同：巴斯克蛋糕使用黄油、糖、鸡蛋制作奶油，用高筋面粉制作模底。芝士蛋糕先使奶酪变软后加入黄油制作模底，蛋黄、酸奶、柠檬汁制作奶油。
芝士蛋糕，也可以叫乳酪蛋糕，主要以芝士为原料制作而成的蛋糕。其分类众多，有重乳酪蛋糕、轻乳酪蛋糕、半熟芝士蛋糕等。如：半熟芝士采用温泉蛋工艺，经过轻度烘焙，使蛋糕表层烤制略微上色，但内部还属于半熟状态，保留嫩滑细腻，恰到好处的半熟口感，是介于重芝士和轻芝士蛋糕之间的味觉体验。
重芝士蛋糕，也可称为重乳酪蛋糕，这类芝士蛋糕属于烤制类芝士蛋糕。其中最出名的便是纽约芝士，其奶油奶酪含量可达80%。轻芝士蛋糕，主要原料也是奶油奶酪。但它和重芝士蛋糕不同在于，它的奶油奶酪使用比例较少，是重芝士的1/2用量或更少。
巴斯克烤芝士蛋糕，来自法国与西班牙交界的一个地区“巴斯克”。这款蛋糕最大的特色就是拥有焦黑的外皮，其貌不扬的外表让人乍一眼以为是做失败的蛋糕。内部是湿润绵密的芝士，烤制后需要进行冷藏一夜后再品尝，奶酪的甜味和表层的焦香在口中散开，相当柔软丝滑。
